《自然是数学设计的图论》的主要方面，是拿举世所无、唯我中华独有的《周易》所载“天地之数”，亦即《河图》、《洛书》作为整体论科学体系的终极设计，对还原论科学体系作出某种新的对比思考，作者认为：历经四百年对科学的发展作出了巨大贡献的还原论，现在已和加速度发展的新形势不相适应，一个典型的例子，1965年射电天文学精确地测准了水星的自转周期为58.646天，等于它的公转周期87.969天的2／3，但是无法作出解答为什么必须如此。