《生物信息学词汇双语通解》共分为三部分,一部分是生物专业词汇,一部分是该词汇的英文释义,最后一部分为词汇的中文释义。这种结构方便读者查阅,即使中文解释不到位,亦可与英文解释对照理解词义。《生物信息学词汇双语通解》还可以作为EMBOSS应用程序的说明文档之用,所有应用程序以斜体字区别表示。